Eğer mysql sunucunuzda connection listesinde sleep düşümüş çok fazlla connetion görüyor ve bu sorundan dolayı mysql sunucunuz kitleniyorsa aşağıdaki değerleri windowsta my.ini içine linuxta ise genelde /etc/my.cnf şeklinde olur onun içine girip mysql servisini restart edin sorununuz düzelecektir.
wait_timeout=50
interactive_timeout=50
linuxta bu şekilde kabul etmez ise aşağıdaki şekilde yapın.

set-variable = wait_timeout=50
set-variable = interactive_timeout=50